你的情况确实特殊，但关系很明确。即，你的工作关系在德国，工资也由德国发，只是工作地点在奥地利而已。就是说，你的主要居留是在德国，你决不能中断你在德国的工作和居留许可！
由于你长期在奥地利工作，又必须申请奥地利居留。你可以申请奥地利受雇特例普通居留，或者公司特派员普通居留。都是不能拿长居的。纳税和保险，都应该在德国解决。
换句话说，你的一切关系都在德国，只不过派到奥地利工作而已。